东南非共同市场的前身为１９８１年成立的东部和南部非洲优惠贸易区。１９９３年１１月，优惠贸易区首脑会议通过了 把贸易区转变为共同市场的条约。１９９４年１２月，优惠贸易区首脑会议正式批准了这一条约，东南非共同市场正式成立。

    东南非共同市场的发展目标是废除成员国之间关税和非关税壁垒，实现商品和劳务的自由流通；协调成员国关税政策，分阶段实现共同对外关税；在贸易、金融、交通运输、工农业、能源和法律等领域进行合作；建立货币联盟，发行共同货币。

    东南非共同市场现有１９个成员国，分别是布隆迪、科摩罗、刚果（金）、吉布提、埃及、厄立特里亚、埃塞俄比亚、肯尼亚、利比亚、马达加斯加、马拉维、毛里求斯、卢旺达、塞舌尔、苏丹、斯威士兰、乌干达、赞比亚和津巴布韦。

    东南非共同市场的主要机构包括首脑会议、部长理事会、政府间委员会、秘书处、技术委员会、贸易和开发银行、结算银行和共同市场法院。首脑会议为最高决策机构，通常每年举行一次会议，也可根据需要临时举行特别会议。

    ２０００年１０月，东南非共同市场在赞比亚首都卢萨卡举行特别首脑会议，决定正式启动自由贸易区。这是非洲第一个自由贸易区。２００７年５月，在肯尼亚首都内罗毕举行的东南非共同市场首脑会议通过了在２００８年年底前建立关税同盟的方案。东南非共同市场的最终目标是２０２５年实现货币同盟，采用统一货币。